Сюжет мультфильма
В центре сюжета аниме "Орган геноцида" мир, погрязший в войне с террором. В один ничем не примечательный день в Сараево происходит взрыв самодельной ядерной бомбы, что приводит к катастрофическим последствиям. Страны, ранее бывшие приверженцами демократического строя, напрочь отказались от данной политической системы и прибегли к тотальному надзору за каждым жителем. Менее развитые державы стали объектами массовых этнических чисток. Светлое будущее перестало быть таковым, мировое равновесие разрушено, а вокруг начали царить паника, хаос и беззаконие. Высшие правительственные чины имеют обоснованные подозрения, что виновен в творящемся беспределе один человек — Джон Пол, гражданин Соединенных Штатов. Клэвису Шепхерду, специальному агенту разведки, мастеру своего дела, поручено отыскать среди руин некогда процветающей цивилизации этого загадочного виновника во всем происходящем.