Сюжет мультфильма
Бэтмен и Женщина-кошка встречаются с Гориллой Гроддом в Аркхеме, когда последний активирует некий механизм. В итоге Темный Рыцарь и Селина Кайл обнаруживают себя в Японии периода Эдо. Вскоре выясняется, что во время путешествий во времени главные злодеи Готэма также прибыли в Страну Восходящего Солнца - Дэтстроук, Ядовитый плющ, Двуликий и Пингвин. Но истинным правителем Японии является сам Джокер, который, вместе с Харли Квинн, теперь взял под свой контроль остров. Бэтмен затем идет в свой замок, чтобы остановить суперзлодея, но терпит поражение. Альфреду удается восстановить Брюса, и при поддержке клана последователей ниндзя, он решает победить пять злых даймё, согласившихся с Гроддом вернуться в настоящее. Поскольку легенда предсказывает прибытие воина, подобного летучей мыши, который принесет мир, Брюс заручается поддержкой верный союзников. Вместе героям аниме-мультфильма "Бэтмен-ниндзя" предстоит остановить сумасшедший план Джокера и активировать устройство Гродда, чтобы вернуться домой.